骑上黑陆行鸟来到世界地图右上角的沙漠，这里有一片小树林，是唯一可来这里的交通工具黑陆行鸟的着陆点。在东北的北山。在最后的地方遇到巴哈姆特，打赢它便可获得作为召唤兽的它，记得让自己状态以应付巴哈姆特强力的魔法。之后来到西南角塔里。
这个塔非常高，所以层数也非常多，但是每个迷宫却很小，在后作FF VI的狂信者之塔和FF VII的神罗大楼以及FF VIII的沙漠监狱也延续了这种布局。塔的迷宫只迷在一点：那就是基本上每一层都只能看到入口和墙壁，往上的通路被隐藏起来，需要在墙上调查。一般墙壁上有两处可以调查的地方，一个是正路，另一个是敌人，所以就要你碰运气选了...
入隐藏楼梯前必须和怪物作战。上到30层会发现飞龙，它为了帮助蕾娜尽了最后的力量，此时它也已知道自己命不久矣，纵身跳下塔去。……
第四石板在西北的海底洞穴，里面要和海洋王战斗，胜利后就能得到它的力量！取得四块石板，便可以拿到封印之城的全部神器了，现在，要进入决战的时刻了！来到被毁灭的泰空城上空后就会进入次元狭缝，飞空艇停留在有水的沙漠前，次元狭缝里就是这么古怪。若想回到现实世界，用魔法转移或原路返回至飞空艇即可。通过简单的沙漠和遗迹后来到了时间停止的海市蜃楼村，从这里进入大森林后来到黑暗洞穴，再到达古代图书馆，接着会到达黑暗之塔并最终到达黑暗之城。
次元城里的道路很难找到，基本都隐藏起来的，没玩过SFC版本的玩家可能会有点困难，在监狱里能救出一个女人，跟着她就能到达王座，而刚才的女人竟然是这里的城主，击败她后就能继续前进了。在最后的次元夹缝里，又和基加美修见面了，打败他后他会彻底的醒悟过来，牺牲了自己使主角们到达了最终的地点，在那里，艾克斯迪司等着主角，第一战他会使用魔树形态，他使出了黑暗之力把主角们带到了黑暗空间里，在那里，主角们的全部力量都被吸光了，在最后的光头，原来的光之四战士和国王的灵魂出现了，他们把黑暗之力给抵挡住，乘着现在，主角们和艾克斯迪司展开了最终的决斗，这里他有两个形态，只要小心第二场战斗就行了，胜利后，也迎来了我们的大结局。
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